Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP5P82980 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP5P82980 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP5P82980 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP5P82980 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP5P82980 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBP5P82980 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBP5P82980 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP5P82980 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP5P82980 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP5P82980 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP5P82980 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP5P82980 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP5P82980 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP5P82980 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP5P82980 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP5P82980 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBP5P82980 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP5P82980 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP5P82980 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP5P82980 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP5P82980 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP5P82980 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP5P82980 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP5P82980 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP5P82980 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP5P82980 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBP5P82980 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP5P82980 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP5P82980 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP5P82980 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP5P82980 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP5P82980 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP5P82980 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP5P82980 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP5P82980 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP5P82980 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP5P82980 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP5P82980 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBP5P82980 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBP5P82980 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBP5P82980 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP5P82980 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP5P82980 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP5P82980 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP5P82980 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP5P82980 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP5P82980 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP5P82980 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP5P82980 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP5P82980 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBP5P82980 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBP5P82980 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBP5P82980 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms