Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMF1P82094 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMF1P82094 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMF1P82094 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMF1P82094 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMF1P82094 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMF1P82094 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMF1P82094 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMF1P82094 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMF1P82094 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMF1P82094 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMF1P82094 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMF1P82094 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TMF1P82094 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMF1P82094 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMF1P82094 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMF1P82094 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMF1P82094 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TMF1P82094 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMF1P82094 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMF1P82094 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMF1P82094 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TMF1P82094 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMF1P82094 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMF1P82094 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMF1P82094 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMF1P82094 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMF1P82094 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMF1P82094 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMF1P82094 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMF1P82094 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMF1P82094 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMF1P82094 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMF1P82094 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMF1P82094 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMF1P82094 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMF1P82094 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMF1P82094 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMF1P82094 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMF1P82094 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMF1P82094 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMF1P82094 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMF1P82094 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMF1P82094 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMF1P82094 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TMF1P82094 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMF1P82094 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMF1P82094 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMF1P82094 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMF1P82094 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMF1P82094 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMF1P82094 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMF1P82094 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMF1P82094 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMF1P82094 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMF1P82094 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMF1P82094 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMF1P82094 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMF1P82094 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMF1P82094 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMF1P82094 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMF1P82094 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TMF1P82094 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMF1P82094 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMF1P82094 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMF1P82094 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMF1P82094 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMF1P82094 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMF1P82094 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TMF1P82094 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMF1P82094 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMF1P82094 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMF1P82094 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMF1P82094 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TMF1P82094 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMF1P82094 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMF1P82094 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMF1P82094 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TMF1P82094 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMF1P82094 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMF1P82094 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms