Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX4P78413 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX4P78413 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX4P78413 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX4P78413 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX4P78413 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX4P78413 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX4P78413 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX4P78413 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRX4P78413 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX4P78413 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX4P78413 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX4P78413 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX4P78413 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX4P78413 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX4P78413 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX4P78413 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX4P78413 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX4P78413 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRX4P78413 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRX4P78413 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX4P78413 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX4P78413 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX4P78413 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX4P78413 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX4P78413 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX4P78413 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX4P78413 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX4P78413 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX4P78413 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms