Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM193AP78312 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM193AP78312 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms