Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
HERVK_113P63121 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERVK_113P63121 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms