Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBA52P62987 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBA52P62987 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBA52P62987 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBA52P62987 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBA52P62987 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBA52P62987 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBA52P62987 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBA52P62987 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBA52P62987 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBA52P62987 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBA52P62987 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
UBA52P62987 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBA52P62987 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBA52P62987 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBA52P62987 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBA52P62987 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBA52P62987 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBA52P62987 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBA52P62987 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBA52P62987 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBA52P62987 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBA52P62987 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBA52P62987 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBA52P62987 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBA52P62987 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBA52P62987 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBA52P62987 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBA52P62987 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
UBA52P62987 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms