Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLR2FP61218 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR2FP61218 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms