Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARF3P61204 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARF3P61204 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARF3P61204 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARF3P61204 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ARF3P61204 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF3P61204 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARF3P61204 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms