Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCDC1P59894 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DCDC1P59894 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DCDC1P59894 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DCDC1P59894 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCDC1P59894 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCDC1P59894 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC1P59894 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC1P59894 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC1P59894 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC1P59894 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DCDC1P59894 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC1P59894 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC1P59894 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC1P59894 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DCDC1P59894 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DCDC1P59894 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DCDC1P59894 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC1P59894 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC1P59894 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC1P59894 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC1P59894 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC1P59894 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC1P59894 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC1P59894 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC1P59894 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC1P59894 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC1P59894 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC1P59894 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DCDC1P59894 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms