Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PROK1P58294 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PROK1P58294 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PROK1P58294 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PROK1P58294 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PROK1P58294 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PROK1P58294 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PROK1P58294 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PROK1P58294 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PROK1P58294 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PROK1P58294 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PROK1P58294 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PROK1P58294 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PROK1P58294 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PROK1P58294 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PROK1P58294 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PROK1P58294 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PROK1P58294 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PROK1P58294 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PROK1P58294 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PROK1P58294 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PROK1P58294 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PROK1P58294 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PROK1P58294 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PROK1P58294 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PROK1P58294 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PROK1P58294 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PROK1P58294 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PROK1P58294 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PROK1P58294 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PROK1P58294 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms