Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA9P57773 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA9P57773 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GJA9P57773 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GJA9P57773 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA9P57773 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA9P57773 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA9P57773 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA9P57773 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA9P57773 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA9P57773 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA9P57773 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA9P57773 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA9P57773 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA9P57773 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA9P57773 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA9P57773 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GJA9P57773 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GJA9P57773 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA9P57773 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA9P57773 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA9P57773 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA9P57773 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA9P57773 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA9P57773 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA9P57773 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA9P57773 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA9P57773 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA9P57773 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJA9P57773 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJA9P57773 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA9P57773 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA9P57773 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA9P57773 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA9P57773 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA9P57773 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA9P57773 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA9P57773 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA9P57773 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJA9P57773 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJA9P57773 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms