Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX16P57768 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX16P57768 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX16P57768 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX16P57768 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX16P57768 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX16P57768 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX16P57768 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX16P57768 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX16P57768 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX16P57768 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX16P57768 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX16P57768 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX16P57768 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX16P57768 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX16P57768 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX16P57768 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX16P57768 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX16P57768 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX16P57768 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX16P57768 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX16P57768 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX16P57768 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX16P57768 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX16P57768 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX16P57768 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX16P57768 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX16P57768 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX16P57768 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX16P57768 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX16P57768 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX16P57768 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX16P57768 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX16P57768 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX16P57768 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX16P57768 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms