Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CASP9P55211 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP9P55211 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP9P55211 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP9P55211 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP9P55211 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP9P55211 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP9P55211 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP9P55211 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP9P55211 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CASP9P55211 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CASP9P55211 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CASP9P55211 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CASP9P55211 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CASP9P55211 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CASP9P55211 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms