Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDF10P55107 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF10P55107 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF10P55107 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF10P55107 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF10P55107 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF10P55107 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF10P55107 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF10P55107 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF10P55107 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDF10P55107 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF10P55107 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF10P55107 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF10P55107 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF10P55107 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF10P55107 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF10P55107 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF10P55107 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF10P55107 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF10P55107 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF10P55107 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDF10P55107 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GDF10P55107 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDF10P55107 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF10P55107 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF10P55107 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF10P55107 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF10P55107 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF10P55107 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF10P55107 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF10P55107 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF10P55107 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF10P55107 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF10P55107 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDF10P55107 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF10P55107 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDF10P55107 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF10P55107 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF10P55107 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF10P55107 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF10P55107 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF10P55107 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF10P55107 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF10P55107 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF10P55107 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF10P55107 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF10P55107 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF10P55107 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF10P55107 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDF10P55107 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF10P55107 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF10P55107 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF10P55107 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF10P55107 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF10P55107 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF10P55107 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF10P55107 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF10P55107 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF10P55107 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF10P55107 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF10P55107 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF10P55107 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GDF10P55107 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GDF10P55107 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF10P55107 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF10P55107 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF10P55107 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF10P55107 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF10P55107 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF10P55107 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GDF10P55107 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms