Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA2D1P54289 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA2D1P54289 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms