Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNB3P54284 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms