Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRISP3P54108 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRISP3P54108 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms