Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIMK2P53671 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIMK2P53671 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIMK2P53671 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LIMK2P53671 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIMK2P53671 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIMK2P53671 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIMK2P53671 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIMK2P53671 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIMK2P53671 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIMK2P53671 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIMK2P53671 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIMK2P53671 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIMK2P53671 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIMK2P53671 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms