Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARFIP2P53365 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARFIP2P53365 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms