Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX1P52954 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX1P52954 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX1P52954 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX1P52954 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX1P52954 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX1P52954 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX1P52954 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX1P52954 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX1P52954 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX1P52954 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX1P52954 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX1P52954 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX1P52954 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX1P52954 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX1P52954 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX1P52954 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX1P52954 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX1P52954 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX1P52954 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX1P52954 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX1P52954 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX1P52954 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX1P52954 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX1P52954 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX1P52954 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX1P52954 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX1P52954 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX1P52954 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX1P52954 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX1P52954 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX1P52954 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX1P52954 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX1P52954 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX1P52954 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX1P52954 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX1P52954 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX1P52954 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX1P52954 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX1P52954 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX1P52954 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX1P52954 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX1P52954 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX1P52954 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX1P52954 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX1P52954 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX1P52954 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX1P52954 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX1P52954 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX1P52954 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX1P52954 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX1P52954 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX1P52954 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX1P52954 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX1P52954 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX1P52954 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX1P52954 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX1P52954 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX1P52954 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LBX1P52954 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LBX1P52954 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LBX1P52954 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LBX1P52954 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LBX1P52954 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LBX1P52954 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LBX1P52954 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LBX1P52954 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LBX1P52954 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LBX1P52954 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LBX1P52954 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LBX1P52954 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LBX1P52954 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LBX1P52954 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms