Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST2P52849 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST2P52849 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST2P52849 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST2P52849 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST2P52849 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDST2P52849 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDST2P52849 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDST2P52849 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST2P52849 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NDST2P52849 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST2P52849 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST2P52849 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST2P52849 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST2P52849 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST2P52849 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST2P52849 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST2P52849 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDST2P52849 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NDST2P52849 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDST2P52849 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NDST2P52849 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST2P52849 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST2P52849 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST2P52849 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST2P52849 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST2P52849 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST2P52849 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDST2P52849 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDST2P52849 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDST2P52849 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDST2P52849 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDST2P52849 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NDST2P52849 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDST2P52849 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDST2P52849 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDST2P52849 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDST2P52849 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDST2P52849 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NDST2P52849 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NDST2P52849 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDST2P52849 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDST2P52849 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NDST2P52849 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDST2P52849 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDST2P52849 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDST2P52849 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDST2P52849 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDST2P52849 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDST2P52849 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDST2P52849 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDST2P52849 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDST2P52849 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms