Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFNA3P52797 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms