Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP11P51784 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP11P51784 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP11P51784 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP11P51784 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP11P51784 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP11P51784 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP11P51784 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP11P51784 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP11P51784 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP11P51784 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP11P51784 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP11P51784 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP11P51784 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP11P51784 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP11P51784 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP11P51784 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP11P51784 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP11P51784 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP11P51784 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP11P51784 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP11P51784 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP11P51784 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP11P51784 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP11P51784 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP11P51784 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP11P51784 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP11P51784 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP11P51784 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP11P51784 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP11P51784 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP11P51784 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP11P51784 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP11P51784 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP11P51784 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP11P51784 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP11P51784 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP11P51784 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP11P51784 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP11P51784 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP11P51784 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP11P51784 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP11P51784 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP11P51784 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP11P51784 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP11P51784 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP11P51784 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP11P51784 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP11P51784 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP11P51784 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP11P51784 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP11P51784 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP11P51784 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP11P51784 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP11P51784 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP11P51784 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP11P51784 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP11P51784 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP11P51784 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP11P51784 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP11P51784 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP11P51784 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP11P51784 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP11P51784 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP11P51784 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms