Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX5P50542 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX5P50542 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX5P50542 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX5P50542 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX5P50542 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX5P50542 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX5P50542 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX5P50542 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX5P50542 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX5P50542 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX5P50542 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX5P50542 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX5P50542 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX5P50542 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX5P50542 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX5P50542 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX5P50542 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX5P50542 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX5P50542 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX5P50542 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX5P50542 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX5P50542 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX5P50542 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX5P50542 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX5P50542 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX5P50542 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX5P50542 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX5P50542 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX5P50542 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX5P50542 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX5P50542 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX5P50542 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX5P50542 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX5P50542 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX5P50542 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX5P50542 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX5P50542 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX5P50542 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX5P50542 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX5P50542 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX5P50542 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX5P50542 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX5P50542 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX5P50542 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX5P50542 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX5P50542 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms