Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RARRES1P49788 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARRES1P49788 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms