Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLK2P49760 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK2P49760 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK2P49760 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK2P49760 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK2P49760 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK2P49760 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK2P49760 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK2P49760 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK2P49760 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLK2P49760 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLK2P49760 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK2P49760 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK2P49760 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK2P49760 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK2P49760 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK2P49760 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK2P49760 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK2P49760 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK2P49760 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK2P49760 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK2P49760 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK2P49760 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLK2P49760 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK2P49760 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK2P49760 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK2P49760 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK2P49760 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK2P49760 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK2P49760 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK2P49760 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK2P49760 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK2P49760 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK2P49760 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK2P49760 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK2P49760 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLK2P49760 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLK2P49760 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLK2P49760 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK2P49760 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK2P49760 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK2P49760 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK2P49760 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK2P49760 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK2P49760 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK2P49760 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK2P49760 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLK2P49760 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLK2P49760 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK2P49760 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK2P49760 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLK2P49760 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms