Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCT3P49368 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCT3P49368 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCT3P49368 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCT3P49368 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCT3P49368 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCT3P49368 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCT3P49368 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCT3P49368 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCT3P49368 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCT3P49368 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCT3P49368 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCT3P49368 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCT3P49368 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCT3P49368 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCT3P49368 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCT3P49368 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCT3P49368 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCT3P49368 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCT3P49368 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCT3P49368 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCT3P49368 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCT3P49368 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCT3P49368 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCT3P49368 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCT3P49368 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCT3P49368 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCT3P49368 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCT3P49368 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCT3P49368 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCT3P49368 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCT3P49368 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCT3P49368 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCT3P49368 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCT3P49368 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCT3P49368 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCT3P49368 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT3P49368 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT3P49368 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT3P49368 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT3P49368 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT3P49368 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT3P49368 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT3P49368 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT3P49368 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT3P49368 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT3P49368 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT3P49368 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCT3P49368 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCT3P49368 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms