Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNTAP49354 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNTAP49354 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNTAP49354 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNTAP49354 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNTAP49354 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNTAP49354 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FNTAP49354 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNTAP49354 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNTAP49354 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNTAP49354 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNTAP49354 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNTAP49354 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FNTAP49354 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FNTAP49354 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNTAP49354 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNTAP49354 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNTAP49354 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNTAP49354 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNTAP49354 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNTAP49354 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNTAP49354 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNTAP49354 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNTAP49354 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNTAP49354 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNTAP49354 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNTAP49354 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNTAP49354 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FNTAP49354 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNTAP49354 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FNTAP49354 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FNTAP49354 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNTAP49354 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNTAP49354 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FNTAP49354 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNTAP49354 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNTAP49354 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNTAP49354 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNTAP49354 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FNTAP49354 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNTAP49354 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNTAP49354 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNTAP49354 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNTAP49354 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNTAP49354 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNTAP49354 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNTAP49354 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNTAP49354 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNTAP49354 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNTAP49354 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNTAP49354 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNTAP49354 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNTAP49354 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNTAP49354 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms