Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC11A1P49279 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC11A1P49279 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms