Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTDSS1P48651 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms