Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NMUP48645 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMUP48645 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMUP48645 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMUP48645 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMUP48645 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMUP48645 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMUP48645 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMUP48645 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMUP48645 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMUP48645 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMUP48645 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NMUP48645 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NMUP48645 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMUP48645 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMUP48645 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMUP48645 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMUP48645 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMUP48645 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMUP48645 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMUP48645 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMUP48645 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMUP48645 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NMUP48645 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NMUP48645 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NMUP48645 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMUP48645 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMUP48645 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMUP48645 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMUP48645 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMUP48645 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMUP48645 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMUP48645 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMUP48645 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMUP48645 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NMUP48645 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NMUP48645 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMUP48645 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMUP48645 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMUP48645 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMUP48645 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMUP48645 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMUP48645 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NMUP48645 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NMUP48645 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms