Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLCP48506 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLCP48506 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLCP48506 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLCP48506 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLCP48506 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLCP48506 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLCP48506 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLCP48506 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLCP48506 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLCP48506 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GCLCP48506 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GCLCP48506 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLCP48506 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLCP48506 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLCP48506 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLCP48506 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLCP48506 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GCLCP48506 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLCP48506 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLCP48506 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLCP48506 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLCP48506 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLCP48506 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLCP48506 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLCP48506 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLCP48506 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLCP48506 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLCP48506 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLCP48506 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GCLCP48506 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GCLCP48506 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GCLCP48506 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLCP48506 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLCP48506 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLCP48506 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLCP48506 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLCP48506 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLCP48506 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLCP48506 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GCLCP48506 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLCP48506 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLCP48506 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLCP48506 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLCP48506 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLCP48506 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLCP48506 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLCP48506 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLCP48506 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLCP48506 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLCP48506 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms