Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UTRNP46939 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UTRNP46939 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
UTRNP46939 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
UTRNP46939 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
UTRNP46939 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UTRNP46939 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UTRNP46939 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UTRNP46939 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
UTRNP46939 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UTRNP46939 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
UTRNP46939 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UTRNP46939 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UTRNP46939 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
UTRNP46939 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UTRNP46939 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UTRNP46939 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UTRNP46939 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UTRNP46939 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UTRNP46939 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UTRNP46939 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UTRNP46939 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UTRNP46939 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
UTRNP46939 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UTRNP46939 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UTRNP46939 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UTRNP46939 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UTRNP46939 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
UTRNP46939 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UTRNP46939 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
UTRNP46939 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
UTRNP46939 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UTRNP46939 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UTRNP46939 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UTRNP46939 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UTRNP46939 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UTRNP46939 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UTRNP46939 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UTRNP46939 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UTRNP46939 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UTRNP46939 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
UTRNP46939 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UTRNP46939 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UTRNP46939 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UTRNP46939 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UTRNP46939 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UTRNP46939 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UTRNP46939 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
UTRNP46939 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UTRNP46939 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UTRNP46939 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UTRNP46939 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UTRNP46939 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UTRNP46939 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UTRNP46939 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UTRNP46939 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UTRNP46939 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UTRNP46939 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UTRNP46939 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UTRNP46939 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UTRNP46939 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UTRNP46939 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UTRNP46939 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UTRNP46939 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UTRNP46939 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UTRNP46939 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UTRNP46939 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UTRNP46939 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UTRNP46939 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UTRNP46939 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UTRNP46939 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UTRNP46939 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UTRNP46939 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UTRNP46939 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UTRNP46939 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
UTRNP46939 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UTRNP46939 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UTRNP46939 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UTRNP46939 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UTRNP46939 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UTRNP46939 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UTRNP46939 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UTRNP46939 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UTRNP46939 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UTRNP46939 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UTRNP46939 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UTRNP46939 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UTRNP46939 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UTRNP46939 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UTRNP46939 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UTRNP46939 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UTRNP46939 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UTRNP46939 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UTRNP46939 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UTRNP46939 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UTRNP46939 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UTRNP46939 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UTRNP46939 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UTRNP46939 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UTRNP46939 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms