Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRXP46100 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRXP46100 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRXP46100 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRXP46100 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRXP46100 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRXP46100 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRXP46100 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRXP46100 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRXP46100 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRXP46100 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRXP46100 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ATRXP46100 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ATRXP46100 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ATRXP46100 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATRXP46100 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATRXP46100 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATRXP46100 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATRXP46100 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATRXP46100 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATRXP46100 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATRXP46100 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ATRXP46100 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATRXP46100 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATRXP46100 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATRXP46100 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATRXP46100 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATRXP46100 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ATRXP46100 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ATRXP46100 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRXP46100 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRXP46100 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRXP46100 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRXP46100 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRXP46100 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRXP46100 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRXP46100 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRXP46100 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRXP46100 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRXP46100 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRXP46100 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRXP46100 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATRXP46100 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRXP46100 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRXP46100 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRXP46100 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRXP46100 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRXP46100 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRXP46100 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRXP46100 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRXP46100 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRXP46100 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRXP46100 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRXP46100 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATRXP46100 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms