Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH1P40692 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH1P40692 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH1P40692 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH1P40692 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH1P40692 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLH1P40692 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH1P40692 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH1P40692 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH1P40692 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH1P40692 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH1P40692 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH1P40692 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH1P40692 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH1P40692 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH1P40692 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH1P40692 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH1P40692 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLH1P40692 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MLH1P40692 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH1P40692 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH1P40692 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH1P40692 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH1P40692 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH1P40692 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH1P40692 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH1P40692 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MLH1P40692 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH1P40692 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH1P40692 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH1P40692 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH1P40692 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH1P40692 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH1P40692 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH1P40692 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH1P40692 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH1P40692 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH1P40692 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MLH1P40692 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH1P40692 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH1P40692 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH1P40692 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH1P40692 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH1P40692 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH1P40692 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH1P40692 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH1P40692 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH1P40692 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH1P40692 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MLH1P40692 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH1P40692 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH1P40692 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH1P40692 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH1P40692 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH1P40692 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH1P40692 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH1P40692 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH1P40692 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH1P40692 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH1P40692 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH1P40692 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH1P40692 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH1P40692 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH1P40692 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH1P40692 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH1P40692 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH1P40692 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH1P40692 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH1P40692 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH1P40692 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH1P40692 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH1P40692 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH1P40692 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MLH1P40692 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms