Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PBX2P40425 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX2P40425 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX2P40425 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX2P40425 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX2P40425 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX2P40425 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX2P40425 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX2P40425 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX2P40425 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX2P40425 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX2P40425 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX2P40425 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX2P40425 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PBX2P40425 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBX2P40425 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX2P40425 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX2P40425 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX2P40425 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX2P40425 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX2P40425 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX2P40425 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX2P40425 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX2P40425 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX2P40425 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX2P40425 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX2P40425 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBX2P40425 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX2P40425 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX2P40425 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX2P40425 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX2P40425 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX2P40425 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX2P40425 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBX2P40425 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBX2P40425 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PBX2P40425 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PBX2P40425 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PBX2P40425 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PBX2P40425 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBX2P40425 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX2P40425 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX2P40425 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX2P40425 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms