Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CEACAM3P40198 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms