Protein–RNA interactions for Protein: P39928

SLN1, Osmosensing histidine protein kinase SLN1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLN1P39928 DAS1YJL149W 1992 nt5.51□□□□□ -1.53
SLN1P39928 PES4YFR023W 1836 nt5.51□□□□□ -1.53
SLN1P39928 AAD3YCR107W 1092 nt5.51□□□□□ -1.53
SLN1P39928 NUS1YDL193W 1128 nt5.51□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YER079WYER079W 633 nt5.51□□□□□ -1.53
SLN1P39928 APE1YKL103C 1545 nt5.51□□□□□ -1.53
SLN1P39928 GPR1YDL035C 2886 nt5.51□□□□□ -1.53
SLN1P39928 BUD7YOR299W 2241 nt5.51□□□□□ -1.53
SLN1P39928 RTC5YOR118W 1704 nt5.51□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YER068C-AYER068C-A 432 nt5.5□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YGR073CYGR073C 372 nt5.5□□□□□ -1.53
SLN1P39928 GPP1YIL053W 753 nt5.5□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YLR125WYLR125W 411 nt5.5□□□□□ -1.53
SLN1P39928 MED7YOL135C 669 nt5.5□□□□□ -1.53
SLN1P39928 ARC40YBR234C 1155 nt5.5□□□□□ -1.53
SLN1P39928 MRPL27YBR282W 441 nt5.5□□□□□ -1.53
SLN1P39928 SLY41YOR307C 1362 nt5.5□□□□□ -1.53
SLN1P39928 ADY3YDL239C 2373 nt5.5□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YCL020WYCL020W 1317 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 TAF5YBR198C 2397 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 TMA20YER007C-A 546 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YER158W-AYER158W-A 216 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 SPT2YER161C 1002 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YHR138CYHR138C 345 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 PCL7YIL050W 858 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YJR012CYJR012C 624 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 APS1YLR170C 471 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 RPL15BYMR121C 615 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YMR111CYMR111C 1389 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 SNU56YDR240C 1479 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 TOS3YGL179C 1683 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 SIR1YKR101W 1965 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 PSE1YMR308C 3270 nt5.49□□□□□ -1.53
SLN1P39928 MSN4YKL062W 1893 nt5.48□□□□□ -1.53
SLN1P39928 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt5.48□□□□□ -1.53
SLN1P39928 VPS51YKR020W 495 nt5.48□□□□□ -1.53
SLN1P39928 SRP40YKR092C 1221 nt5.48□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt5.48□□□□□ -1.53
SLN1P39928 RPP0YLR340W 939 nt5.48□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YBL010CYBL010C 843 nt5.48□□□□□ -1.53
SLN1P39928 SYC1YOR179C 567 nt5.48□□□□□ -1.53
SLN1P39928 SWI3YJL176C 2478 nt5.48□□□□□ -1.53
SLN1P39928 UBC9YDL064W 474 nt5.47□□□□□ -1.53
SLN1P39928 YER087C-AYER087C-A 552 nt5.47□□□□□ -1.53
SLN1P39928 SOP4YJL192C 705 nt5.47□□□□□ -1.53
SLN1P39928 TOM22YNL131W 459 nt5.47□□□□□ -1.53
SLN1P39928 MIC60YKR016W 1623 nt5.47□□□□□ -1.53
SLN1P39928 FAA4YMR246W 2085 nt5.47□□□□□ -1.53
SLN1P39928 OLE1YGL055W 1533 nt5.47□□□□□ -1.53
SLN1P39928 PAH1YMR165C 2589 nt5.47□□□□□ -1.53
SLN1P39928 ALG9YNL219C 1668 nt5.47□□□□□ -1.53
SLN1P39928 RPN4YDL020C 1596 nt5.46□□□□□ -1.53
SLN1P39928 SSB2YNL209W 1842 nt5.46□□□□□ -1.53
SLN1P39928 SLD5YDR489W 885 nt5.46□□□□□ -1.54
SLN1P39928 HUR1YGL168W 333 nt5.46□□□□□ -1.54
SLN1P39928 LSB1YGR136W 726 nt5.46□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt5.46□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YKL107WYKL107W 930 nt5.46□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt5.46□□□□□ -1.54
SLN1P39928 CYC2YOR037W 1101 nt5.46□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YOR366WYOR366W 354 nt5.46□□□□□ -1.54
SLN1P39928 RRP3YHR065C 1506 nt5.46□□□□□ -1.54
SLN1P39928 GGA1YDR358W 1674 nt5.46□□□□□ -1.54
SLN1P39928 GMC1YDR506C 1827 nt5.46□□□□□ -1.54
SLN1P39928 GAL80YML051W 1308 nt5.46□□□□□ -1.54
SLN1P39928 AKL1YBR059C 3327 nt5.45□□□□□ -1.54
SLN1P39928 IML2YJL082W 2196 nt5.45□□□□□ -1.54
SLN1P39928 CTT1YGR088W 1689 nt5.45□□□□□ -1.54
SLN1P39928 MAM33YIL070C 801 nt5.45□□□□□ -1.54
SLN1P39928 RPS30AYLR287C-A 192 nt5.45□□□□□ -1.54
SLN1P39928 ATG8YBL078C 354 nt5.45□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YPL088WYPL088W 1029 nt5.45□□□□□ -1.54
SLN1P39928 ICY2YPL250C 411 nt5.45□□□□□ -1.54
SLN1P39928 RCK2YLR248W 1833 nt5.45□□□□□ -1.54
SLN1P39928 PRM2YIL037C 1971 nt5.45□□□□□ -1.54
SLN1P39928 SYP1YCR030C 2613 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 CDC37YDR168W 1521 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 CNA1YLR433C 1662 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 PRT1YOR361C 2292 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 RPS16BYDL083C 432 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 GCN4YEL009C 846 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 ISC10YER180C 804 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 LIF1YGL090W 1266 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YPT7YML001W 627 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 JLP2YMR132C 627 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YOL159CYOL159C 516 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 BMT2YBR141C 1014 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 VBA2YBR293W 1425 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 EGT2YNL327W 3126 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 MOT2YER068W 1764 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 MPP10YJR002W 1782 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 ZPR1YGR211W 1461 nt5.44□□□□□ -1.54
SLN1P39928 HOT1YMR172W 2160 nt5.43□□□□□ -1.54
SLN1P39928 YDR535CYDR535C 501 nt5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.6 ms