Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
HSPA9P38646 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms