Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ZEB1P37275 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZEB1P37275 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms