Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SREBF1P36956 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SREBF1P36956 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms