Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBRP36941 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBRP36941 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBRP36941 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBRP36941 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBRP36941 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBRP36941 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBRP36941 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBRP36941 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBRP36941 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBRP36941 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBRP36941 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBRP36941 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBRP36941 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBRP36941 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBRP36941 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBRP36941 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBRP36941 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBRP36941 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBRP36941 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBRP36941 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBRP36941 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBRP36941 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBRP36941 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBRP36941 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBRP36941 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBRP36941 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBRP36941 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBRP36941 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBRP36941 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBRP36941 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBRP36941 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBRP36941 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBRP36941 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBRP36941 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBRP36941 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBRP36941 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBRP36941 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBRP36941 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBRP36941 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBRP36941 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBRP36941 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBRP36941 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBRP36941 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBRP36941 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBRP36941 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBRP36941 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBRP36941 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBRP36941 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBRP36941 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms