Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDIT3P35638 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DDIT3P35638 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDIT3P35638 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms