Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD13P35453 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXD13P35453 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms