Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPA3P35244 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPA3P35244 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPA3P35244 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPA3P35244 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA3P35244 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA3P35244 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA3P35244 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA3P35244 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA3P35244 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA3P35244 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA3P35244 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA3P35244 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA3P35244 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPA3P35244 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA3P35244 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA3P35244 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA3P35244 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA3P35244 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA3P35244 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPA3P35244 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPA3P35244 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA3P35244 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA3P35244 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA3P35244 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA3P35244 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA3P35244 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPA3P35244 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms