Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTNNB1P35222 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTNNB1P35222 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms