Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP2P32456 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP2P32456 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP2P32456 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP2P32456 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP2P32456 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP2P32456 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP2P32456 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP2P32456 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP2P32456 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP2P32456 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP2P32456 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP2P32456 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP2P32456 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP2P32456 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBP2P32456 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GBP2P32456 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBP2P32456 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP2P32456 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP2P32456 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP2P32456 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP2P32456 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP2P32456 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP2P32456 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP2P32456 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP2P32456 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP2P32456 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP2P32456 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms