Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNA3P32297 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNA3P32297 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms