Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFNP31947 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFNP31947 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFNP31947 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFNP31947 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFNP31947 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFNP31947 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFNP31947 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SFNP31947 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SFNP31947 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFNP31947 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFNP31947 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SFNP31947 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFNP31947 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SFNP31947 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SFNP31947 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SFNP31947 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SFNP31947 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SFNP31947 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFNP31947 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFNP31947 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFNP31947 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SFNP31947 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFNP31947 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFNP31947 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFNP31947 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFNP31947 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SFNP31947 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SFNP31947 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFNP31947 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFNP31947 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFNP31947 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFNP31947 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFNP31947 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFNP31947 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFNP31947 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFNP31947 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SFNP31947 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SFNP31947 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFNP31947 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFNP31947 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFNP31947 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFNP31947 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFNP31947 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFNP31947 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFNP31947 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFNP31947 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFNP31947 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFNP31947 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFNP31947 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SFNP31947 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SFNP31947 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SFNP31947 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms