Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A4P31645 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A4P31645 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms